ヘルプ: 3Dプリントによる新型コロナウイルスモデル

最近、クマ愛好家らは、新型コロナウイルスのモデルを3Dプリントして、医師や科学者がより直感的に研究しやすくすることをアンタークティック・ベアに提案している。

ウイルス関連情報は「新型コロナウイルスに関する国家科学技術資源サービスシステム」から入手できます。

中国疾病予防管理センターウイルス病予防管理研究所が我が国で初めて分離に成功したウイルス株の情報と電子顕微鏡写真

有害情報<br /> ワクチン番号: CHPC 2020.00001; NPRC 2020.00001
中国名：新型コロナウイルス武漢株01
英語名: C-Tan-nCov 武漢株01
分類: 2019-nCoV、コロナウイルスβ属分離源: 臨床患者採取場所: 中国湖北省武漢市隔離時期: 2020年1月6日バイオハザードレベル: クラスII 連絡先メールアドレス: [email protected]; [email protected]
写真提供：国家病原微生物資源バンク（中国疾病予防管理センターウイルス病予防管理研究所）

2019新型コロナウイルス検出のための特異的プライマーとプローブ

1. 新型コロナウイルス核酸検査（リアルタイム蛍光RT-PCR法）
新型コロナウイルスのオープンリーディングフレーム1ab（ORF1ab）と核タンパク質（N）遺伝子領域をターゲットとしたプライマーとプローブの使用が推奨されます。

ターゲット1（ORF1ab）：
フォワードプライマー（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
リバースプライマー（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
蛍光プローブ（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'

ターゲット2（N）:
フォワードプライマー（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
リバースプライマー（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
蛍光プローブ（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
核酸抽出およびリアルタイム蛍光RT-PCR反応システムについては、各メーカーのキットの説明書を参照してください。

2. 陰性結果: Ct 値がないか、Ct が 40 です。
陽性: Ct 値 <37 は陽性と報告できます。
疑わしい: Ct 値が 37 ～ 40 の間です。実験を繰り返すことをお勧めします。繰り返し結果の Ct 値が 40 未満で、増幅曲線に明らかなピークがある場合、サンプルは陽性と判断され、そうでない場合は陰性と判断されます。

情報元：「新型コロナウイルス国家科学技術資源サービスシステム」公式サイト http://nmdc.cn/#/nCoV

新型コロナウイルスに対する国家科学技術リソースサービスシステム（以下、「システム」という）は、国家微生物科学データと国家病原体リソースバンクが共同で構築し、中国疾病予防管理センター、中国疾病予防管理センターウイルス疾患予防管理研究所、中国科学院微生物研究所、病原体微生物学・免疫学重点実験室、中国科学院微生物研究所病原体微生物学リソース及びビッグデータ共同研究センターなどの部門が共同で構築した。このシステムには、ウイルス株情報、プライマー情報、グローバルコロナウイルス配列情報の照会および分析などの機能があります。このシステムは、国家科学技術資源共有サービスプラットフォーム、エイズやウイルス性肝炎などの主要な感染症予防・管理プロジェクト（2018ZX10734404、2018ZX1010100404）、中国科学院地球ビッグデータ先駆者Aプロジェクト（XDA19050301）、中国科学院戦略バイオリソースプログラム（KFJ-BRP）などのプロジェクトから支援を受けています。

新型コロナウイルスの高解像度結晶構造
2020年1月26日、上海科技大学免疫化学研究所と中国科学院上海薬物研究所による2019-nCoVコロナウイルス感染症に対する合同緊急研究チームは、上海科技大学のRao ZiheとYang Haitaoが率いる研究グループが、より多くの科学技術従事者、特に医薬品開発従事者に利用してもらうため、新型コロナウイルス3CL加水分解酵素（Mpro）の高解像度結晶構造を決定したと発表しました。

△2019-nCoV Mpro結晶構造

結晶構造の座標はPDBタンパク質データバンク（PDB）（PDB ID：6LU7）からダウンロードできると報告されています。タンパク質構造座標が送信され、システムによって処理されています。お急ぎの場合は、上海科技大学免疫化学研究所准研究員の楊秀娜（[email protected]）までご連絡ください。

新型コロナウイルスとヒトACE2分子複合体Sタンパク質の構造モデル
1月21日、科学誌「サイエンスチャイナ：生命科学」は「武漢で発生中の新型コロナウイルスの進化とスパイクタンパク質のヒト感染リスクモデル化」と題する論文を掲載した。中国科学院上海パスツール研究所、軍事医学アカデミー国家応急予防・制御薬物工学工学研究センター/合成生物学重点実験室、中国科学院分子植物生物学卓越センターは共同で、分離された6つの武漢新型コロナウイルス（SARI）の配列がほぼ完全に同一であり、分類上はSARSウイルスに属さないがSARSウイルスに属さないベータコロナウイルス属に属し、類似度は約70％であることを発見した。中東呼吸器症候群（MERS）ウイルスとの類似性はわずか40％である。
SARS ウイルスと MERS ウイルスの一本鎖プラス鎖 RNA ゲノムはエンベロープで包まれており、スパイクタンパク質 (S タンパク質) を持ち、それぞれアンジオテンシン変換酵素 2 (ACE2) タンパク質または DPP4 タンパク質に結合してヒトの呼吸器上皮細胞に感染します。

△新型コロナウイルスとヒトACE2分子複合体Sタンパク質の構造モデル

我が国の3Dプリント業界の技術専門家は、公開されている情報に基づいて、新型コロナウイルスのさまざまな次元（3Dモデル、結晶構造、遺伝子構造など）での3Dモデリングを実行できるでしょうか？それを3Dプリントして関係スタッフに提供して使用してもらうのですか?

複雑な内部の断面構造を表現するために、 3D モデルを設計すれば、透明/半透明/フルカラーの 3D 印刷技術を使用して印刷できます。

△科学者は専門のソフトウェアを使用してコロナウイルスのモデルを構築しました。多くのコロナウイルスは似ています。真の2019-nCoVコロナウイルスはまだ正式に発表されていません。

ある医学博士はアンタークティック・ベアにこう語った。「印刷してみてもいいでしょう。議論することで多くのことがより良くなります。ウイルスを具体的なものにすることで、コミュニケーションや研究に新たなアイデアが生まれるかもしれません。」

協力する意思のある、または協力を必要としている科学者、医師、3D モデリング、3D プリントなどの専門家は、ぜひ集まってこの取り組みに取り組んでください。興味のある専門家は、以下のWeChatグループに参加してください（専門家以外の方は参加しないでください）
QRコードをスキャンして参加できなくなった場合は、まず南極熊カスタマーサービスのWeChat（nanjixiong3）を追加し、「3Dプリントコロナウイルス」というメモを残してください。

ヘルプ: 3Dプリントによる新型コロナウイルスモデル

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